Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pitx2P97474 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms