Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bop1P97452 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms