Protein–RNA interactions for Protein: P97360

Etv6, Transcription factor ETV6, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv6P97360 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Etv6P97360 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv6P97360 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Etv6P97360 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms