Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SmsP97355 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SmsP97355 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SmsP97355 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SmsP97355 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmsP97355 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SmsP97355 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmsP97355 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SmsP97355 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmsP97355 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmsP97355 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SmsP97355 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmsP97355 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmsP97355 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmsP97355 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmsP97355 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SmsP97355 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmsP97355 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmsP97355 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SmsP97355 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SmsP97355 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SmsP97355 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SmsP97355 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmsP97355 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmsP97355 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmsP97355 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmsP97355 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SmsP97355 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SmsP97355 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmsP97355 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SmsP97355 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SmsP97355 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmsP97355 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmsP97355 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms