Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp1P97350 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp1P97350 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms