Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim43bP86448 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim43bP86448 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms