Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vgll3P85442 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vgll3P85442 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms