Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H3f3aP84244 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3f3aP84244 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms