Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf3P70671 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf3P70671 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irf3P70671 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf3P70671 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf3P70671 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms