Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NfixP70257 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NfixP70257 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NfixP70257 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NfixP70257 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NfixP70257 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NfixP70257 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NfixP70257 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NfixP70257 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NfixP70257 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NfixP70257 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NfixP70257 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
NfixP70257 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NfixP70257 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NfixP70257 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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NfixP70257 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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NfixP70257 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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NfixP70257 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NfixP70257 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NfixP70257 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NfixP70257 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NfixP70257 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms