Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chl1P70232 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chl1P70232 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chl1P70232 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chl1P70232 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chl1P70232 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chl1P70232 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chl1P70232 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chl1P70232 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chl1P70232 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chl1P70232 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chl1P70232 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chl1P70232 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Chl1P70232 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Chl1P70232 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Chl1P70232 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chl1P70232 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chl1P70232 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chl1P70232 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chl1P70232 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Chl1P70232 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chl1P70232 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms