Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms