Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrig1P70193 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrig1P70193 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms