Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SbdsP70122 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SbdsP70122 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SbdsP70122 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms