Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtnP63089 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtnP63089 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtnP63089 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtnP63089 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtnP63089 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtnP63089 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtnP63089 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtnP63089 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtnP63089 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtnP63089 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtnP63089 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtnP63089 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtnP63089 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtnP63089 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtnP63089 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtnP63089 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms