Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabrb3P63080 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms