Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr2lP62876 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms