Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lmo4P61969 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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