Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vbp1P61759 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vbp1P61759 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vbp1P61759 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vbp1P61759 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vbp1P61759 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vbp1P61759 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vbp1P61759 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vbp1P61759 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vbp1P61759 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vbp1P61759 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vbp1P61759 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vbp1P61759 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vbp1P61759 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms