Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga11P61622 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga11P61622 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga11P61622 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga11P61622 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms