Protein–RNA interactions for Protein: P61620

Sec61a1, Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61a1P61620 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sec61a1P61620 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec61a1P61620 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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