Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Depdc5P61460 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Depdc5P61460 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms