Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg6P61406 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smg6P61406 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms