Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms