Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf1P61148 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf1P61148 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms