Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chp1P61022 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chp1P61022 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chp1P61022 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chp1P61022 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chp1P61022 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chp1P61022 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp1P61022 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms