Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp4P59240 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms