Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms