Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Senp1P59110 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Senp1P59110 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms