Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Setd4P58467 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd4P58467 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms