Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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