Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmoP56726 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmoP56726 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmoP56726 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmoP56726 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmoP56726 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SmoP56726 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SmoP56726 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SmoP56726 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SmoP56726 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SmoP56726 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SmoP56726 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SmoP56726 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SmoP56726 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SmoP56726 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmoP56726 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmoP56726 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmoP56726 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmoP56726 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmoP56726 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SmoP56726 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms