Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irf5P56477 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irf5P56477 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irf5P56477 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irf5P56477 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irf5P56477 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irf5P56477 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms