Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Gp1bbP56400 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms