Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PltpP55065 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PltpP55065 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PltpP55065 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PltpP55065 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PltpP55065 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PltpP55065 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PltpP55065 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PltpP55065 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PltpP55065 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PltpP55065 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PltpP55065 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PltpP55065 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PltpP55065 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PltpP55065 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PltpP55065 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PltpP55065 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PltpP55065 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PltpP55065 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PltpP55065 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PltpP55065 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PltpP55065 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PltpP55065 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PltpP55065 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PltpP55065 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PltpP55065 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PltpP55065 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PltpP55065 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PltpP55065 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PltpP55065 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PltpP55065 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PltpP55065 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PltpP55065 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PltpP55065 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PltpP55065 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms