Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc12a1P55014 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc12a1P55014 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms