Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad23aP54726 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms