Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PitpnbP53811 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms