Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RabggtbP53612 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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