Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd1P52734 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd1P52734 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd1P52734 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd1P52734 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd1P52734 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd1P52734 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd1P52734 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd1P52734 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd1P52734 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd1P52734 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd1P52734 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgd1P52734 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd1P52734 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd1P52734 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd1P52734 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd1P52734 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd1P52734 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd1P52734 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd1P52734 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd1P52734 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd1P52734 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd1P52734 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd1P52734 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd1P52734 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fgd1P52734 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fgd1P52734 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms