Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Upp1P52624 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Upp1P52624 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms