Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apobec1P51908 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apobec1P51908 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms