Protein–RNA interactions for Protein: P50571

Gabrb1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb1P50571 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gabrb1P50571 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gabrb1P50571 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gabrb1P50571 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gabrb1P50571 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gabrb1P50571 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gabrb1P50571 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gabrb1P50571 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gabrb1P50571 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gabrb1P50571 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gabrb1P50571 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gabrb1P50571 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gabrb1P50571 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gabrb1P50571 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabrb1P50571 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gabrb1P50571 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gabrb1P50571 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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