Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hcls1P49710 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms