Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnni3P48787 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms