Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptx3P48759 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms