Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prox1P48437 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prox1P48437 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms