Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rfx2P48379 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms