Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gli1P47806 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms