Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic1P46684 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms